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苏建忠

发布时间:2020-04-17 10:47:33 浏览量:6712

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苏建忠教授

苏建忠博士,教授、博士生导师,温州医科大学生物医学大数据研究所所长,中国科学院大学温州研究院研究员,国家高层次引进海外人才,浙江省领军人才,浙江省杰出青年基金获得者。主持国家自然科学面上项目、国家自然科学重点基金子课题等科研课题,累计经费1000余万。博士毕业哈尔滨工业大学数学系,美国贝勒医学院分子与细胞生物学博士后,主要从事复杂疾病的遗传和表观遗传数据挖掘,液体活检分子标志物鉴定,单细胞表观基因组检测技术开发和智能算法开发等方面的研究工作。开发在线算法工具和数据库10个,发表高水平SCI论文50余篇(累计影响因子400余点)。其中第一或通讯作者(含共同)在Nature Genetics、Blood、Molecular Cancer、Nature Communications、Genome Biology、Nucleic Acids Research、PNAS及Bioinformatics等国际高水平期刊发表研究论文26篇,H指数24。获省部级科研奖项2项,多次在国内外学术会议发言,参与生物医学信息学论著一项。担任浙江省生物信息学会理事,浙江省生物信息学会健康医学和转化医学委员会主任委员,中国抗癌协会肿瘤标志物专业委员会委员,CCF生物信息专委会委员等学术职务。

个人网站:www.su-lab.org。电子邮箱:sujz@wmu.edu.cn。办公电话:0577-88068273。


研究经历

1. 2018年2月-至今 温州医科大学生物医学大数据研究所 所长、教授、博士生导师

2. 2018年2月-至今 中国科学院大学温州研究院PI、研究员、博士生导师

3. 2014年2月-2018年2月 美国贝勒医学院DanL.Duncan癌症中心 博士后

4. 2013年8月-2014年2月 哈尔滨医科大学生物信息科学与技术学院 副教授

5. 2009年8月-2013年7月 哈尔滨医科大学生物信息科学与技术学院 讲师

6. 2007年7月-2009年7月 哈尔滨医科大学生物信息科学与技术学院 助教


承担科研项目

1. 国家自然基金面上项目:融合多组学数据挖掘食管鳞癌超级抑制子致病基因及其调控机制研究;起止时间:2022/01-2025/12 ;55万元;项目负责人

2. 科技部重点研发计划重点专项:先天性脊柱侧凸关键遗传调控网络的发现及机制研究;起止时间:2020/01-2024/12;100万元;排位2/参与

3. 国家重点研发项目子课题:食管癌演进过程中分子调控网络及关键基因功能异常的分子机制研究;起止时间:2021/01-2024/12;250万元;子课题主持

4. 浙江省自然科学基金杰青项目: 癌症表观基因组生物标志物识别研究 起止时间:2019/01-2022/12,73万元,项目负责人

5. 国家自然科学基金面上项目: 泛癌症异常DNA甲基化标志物识别及其调控机制研究 起止时间:2019/01-2022/12,63万元,项目负责人

6. 国家自然科学基金青年项目: 高通量DNA甲基化数据中识别功能组区域的算法研究 起止时间:2013/01-2015/12,27万元,项目负责人

7. 黑龙江省自然科学基金青年项目: 细胞分化过程表观遗传特征挖掘 起止时间:2012/01-2014/12,10万元,项目负责人


近五年代表性研究论文(*共同一作,#共同通信)

1、Xu L*, Ma Y*, Yuan J*, Zhang Y*, Wang H*, Zhang G, Tu C, Lu X, Li J, Xiong Y, Chen F, Liu X, Xue Z, Zhou M, Li W, Wu N, Bao J, Chen H, Lu F#, Su J#, Qu J#. COVID-19 quarantine reveals behavioral changes effect on myopia progression. Ophthalmology, 2021, S0161-6420(21)00257-8. (中科院一区, IF=12.08)

2、Liu J*, Zhao H*, Huang Y*, Xu S*, Zhou Y, Zhang W, Li J, Ming Y, Wang X, Zhao S, Li K, Dong X, Ma Y, Qian T, Chen X, Xing Z, Zhang Y, Chen H, Liu Z, Pang D, Zhou M, Wu Z, Wang X, Wang X#, Wu N# and Su J#. Genome-wide cell-free DNA methylation analyses improve accuracy of non-invasive diagnostic imaging for early-stage breast cancer. Molecular Cancer, 2021, 20(1):36.( 中科院一区, IF=27.40)

3、Ye B*, Fan D*, Xiong W*, Lin J, Yuan J, Jiang Q, Zhao Y, Li M, Liu J, Lv Y, Wang X, Li Z#, Su J#, Qiao Y#. Oncogenic enhancers drive esophageal squamous cell carcinogenesis and metastasis. Nature Communications, 2021, 12(1):4457(中科院一区, IF=14.92)

4、Xu J, Shi J, Cui X, Cui Y, Li J, Goel A, Chen X, Issa J#, Su J#, Li W#, Cellular heterogeneity–adjusted clonal methylation (CHALM) provides better prediction of gene expression. Nature Communications. 2021, 12(1):400. (中科院一区, IF=14.92)

5、Yu F*, Li  K*, Li S*, Liu J,  Zhang Y,  Zhou M,  Zhao H, Chen H, Wu N, Liu Z#, Su J#: CFEA: a cell-free epigenome atlas in human diseases. Nucleic Acids Research 2020, 48 (D1), D40-D44. (中科院一区, IF=16.97)

6、Liu H*, Zhang Y*, Zhang Y, Li Y, Hua Z, Han F, Jin S, Zhang C, Wu K, Lv J, Yu F, Lin Q, Chen C, Zhang Y, Lu F, Qu J, Su J#, Jin Z#. Human Embryonic Stem Cell-Derived Organoid Retinoblastoma Reveals a Cancerous Origin. Proceedings of the National Academy Sciences. 2020, 117(52):33628-33638(中科院一区,IF=11.21)

7、Zhang X*#, Wang X*, Wang X, Su J# ,Putluri N, Zhou T, Qu Y, Jeong M, Guzman A, Rosas C, Huang Y, Sreekumar A, Li W, Goodell MA: Dnmt3a loss and Idh2 neomorphic mutations mutually potentiate malignant hematopoiesis. Blood 2020, 135 (11): 845–856. (中科院一区,封面, IF=22.11)

8、Su J*#, Huang Y*, Cui X, Zhang X, Wang X, Xin Y, Lin Xue, Chen K, Lv J, Xu J, Goodell MA# and Li W#: Homebox oncogene activation by pan-cancer DNA hypermethylation. Genome Biology 2018, 19:108. (中科院一区, IF=13.58)

9、Huang Y*, Su J*, Lei Y, Brunetti L, Gundry MC, Zhang X, Jeong M, Li W#, Goodell MA#: DNA epigenome editing using CRISPR-Cas SunTag-directed DNMT3A. Genome Biology 2017,16 :176. (中科院一区, IF=13.58)

10、Zhang X*, Su J, Jeong M*, Ko M, Huang Y, Park HJ, Guzman A, Lei Y, Huang YH, Rao A, Li W#, Goodell MA#: DNMT3A and TET2 compete and cooperate to repress lineage-specific transcription factors in hematopoietic stem cells. Nature Genetics 2016, 48(9): 1014–1023. (中科院一区,IF=38.33)


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