徐良德研究员

徐良德博士，温州医科大学附属眼视光医院PI、研究员、硕士生导师，温州医科大学生物医学信息系主任、生物医学大数据研究所副所长。主要学术方向为生物信息学与近视防控大数据研究。曾在Briefings in Bioinformatics、Bioinformatics、Nucleic Acids Research等国际期刊发表SCI收录论文20余篇，累计影响因子超过100点。主持国家自然科学基金、教育部儿童青少年近视防控专项研究课题、浙江省重点研发计划等科研项目12项，在研经费400余万元。主持省级教改课题3项，以编委、副主编身份编写《生物信息学》等国家规划教材和辅助教材7部，指导研究生10人，曾主讲《生物信息学》、《基因组学》等专业课程6门。 

个人网站：www.ibbd.ac.cn/xulab。电子邮箱：xuld(at)eye.ac.cn。办公电话：0577-88068272。

学术兼职

1、教育部全国综合防控儿童青少年近视专家宣讲团专家、秘书长；

2、中国卫生信息与健康医疗大数据学会标准化专业委员会常务委员；

3、中国卫生信息与健康医疗大数据学会近视防控学组常务委员、秘书长；

4、中国抗癌协会骨与软组织肿瘤热疗及生物信息学会副主任委员、秘书长；

5、浙江省生物信息学会青年委员会常务委员；

6、黑龙江省医学健康促进会儿童保健专业委员会常务委员；

7、浙江省卫生健康监测与评价中心专家咨询委员会委员；

8、国家自然科学基金函评专家，浙江省自然科学基金函评专家；

9、Briefings in Bioinformatics、Bioinformatic等国际期刊审稿人；

10、国家八年制医学规划教材《生物信息学》、国家药学规划教材《高等数学》编委。

学习和研究经历

1、2001-09至2009-06 哈尔滨医科大学八年制基础医学本-博连读获医学学士、药理学博士（生物信息学方向）

2、 2009-07至2012-07 哈尔滨医科大学生物信息科学与技术学院讲师

    （2010-10至2018-07 哈医大生物信息学院综合办公室主任）

3、2012-08至2018-07 哈尔滨医科大学生物信息科学与技术学院副教授、硕导

4、2018-07-至今温州医科大学眼视光医（学）院、生物医学工程学院研究员

   （2018-05-至今生物医学大数据研究所副所长）

   （2019-08-至今生物医学信息系主任、眼病大数据智能应用PI）

承担科研项目（近三年）

1、浙江省重点研发计划，2020C03036，基于多模式成像和人工智能的重大致盲性眼病诊治方案研究，2020-01至2022-12，250万元，主持。

2、浙江省近视防控专项基金，浙江省儿童青少年近视风险因素监测与科学决策研究项目，2019-06至2020-12，540万元，主要参与人。

3、国家教育部近视防控专项基金，儿童青少年近视风险因素监测与防控，2019-01至2019-12，132.5万元，主持。

4、温州医科大学人才启动基金，KYQD20190101，基于RNA结构效应估计的近视等眼部疾病风险SNP功能重注释研究，2019-01至2021-12，20万元，主持。

5、温州医科大学附属眼视光医院近视防控专项课题，YGG2018001，儿童青少年近视防控政策与大数据指导决策研究，2018-09至2019-12，20万元，主持。

6、国家自然科学基金青年项目，31501062，基于分子功能的RNA结构效应估计与疾病相关性研究，2016-01至2018-12，直接经费22万元，主持。

主要研究论文（近三年）

1、Lu X, Ding Y, Bai Y, Li J, Zhang G, Wang S, Gao W, Xu L*, Wang H*. Detection of allosteric effects of lncRNA secondary structures altered by SNPs in human diseases. Front Cell Dev Biol. 2020 Apr. doi: 10.3389/fcell.2020.00242. (通讯作者，SCI IF=5.26，中科院2区)

2、Wang H*, Lu X, Chen F, Ding Y, Zheng H, Wang L, Zhang G, Yang J, Bai Y, Li J, Wu J, Zhou M, Xu L*. Landscape of SNPs-mediated lncRNA structural variations and their implication in human complex diseases. Brief Bioinform. 2020 Feb 30;21(1):85-95. doi: 10.1093/bib/bby102. (通讯作者，SCI IF=9.10，中科院1区)

3、Sun J, Zhang Z, Bao S, Yan C, Hou P, Wu N, Su J, Xu L*, Zhou M*. Identification of tumor immune infiltration-associated lncRNAs for improving prognosis and immunotherapy response of patients with non-small cell lung cancer. J Immunother Cancer. 2020 Feb;8(1). pii: e000110. doi: 10.1136/jitc-2019-000110. (通讯作者，SCI IF=8.676，中科院1区)

4、Zhang Y, Xue Z, Guo F, Yu F, Xu L*, Chen H*. Nc2Eye: A Curated ncRNAomics Knowledgebase for Bridging Basic and Clinical Research in Eye Diseases. Front Cell Dev Biol. 2020 Feb 14;8:75. doi: 10.3389/fcell.2020.00075. eCollection 2020. (通讯作者，SCI IF=5.26，中科院2区)

5、Zheng H, X Zhao, H Wang*, Y Ding, X Lu, G Zhang, J Yang, L Wang, H Zhang, Y Bai, J Li, J Wu, Y Jiang, L Xu*. Location deviations of DNA functional elements affected SNP mapping in the published databases and references. Brief Bioinform. 2019 Aug 2. pii: bbz073. doi: 10.1093/bib/bbz073. (通讯作者，SCI IF=9.10，中科院1区)

6、Ding Y, H Wang*, H Zheng, L Wang, G Zhang, J Yang, X Lu, Y Bai, H Zhang, J Li, W Gao, F Chen, S Hu, J Wu, L Xu*. Evaluation of drug efficacy based on the spatial position comparison of drug-target interaction centers. Brief Bioinform. 2019 Mar 13. pii: bbz024. doi: 10.1093/bib/bbz024. (通讯作者，SCI IF=9.10，中科院1区)

7、Liu D, L Zhao, Z Wang, X Zhou, X Fan, Y Li, J Xu, S Hu, M Niu, X Song, Y Li, L Zuo, C Lei, M Zhang, G Tang, M Huang, N Zhang, L Duan, H Lv, M Zhang, J Li, L Xu, F Kong, R Feng, Y Jiang. EWASdb: epigenome-wide association study database. Nucleic Acids Res. 2019 Jan 8;47(D1):D989-D993. doi: 10.1093/nar/gky942. (SCI IF=10.17, 中科院1区)

8、Tang G, H Pan, L Xu, R Feng, Y Jiang, F Kong, S Hu. A Comparison of Co-methylation Relationships Between Rheumatoid Arthritis and Parkinson's Disease. Front Neurosci. 2019 Jan 10;12:1001. doi: 10.3389/fnins.2018.01001. (SCI IF=3.88, 中科院2区)

9、Xu J, L Zhao, D Liu, S Hu, X Song, J Li, H Lv, L Duan, M Zhang, Q Jiang, G Liu, M Liao, M Zhang, R Feng, F Kong, L Xu*, Y Jiang*. EWAS: epigenome-wide association study software 2.0. Bioinformatics, 2018 Aug 1;34(15):2657-2658. doi: 10.1093/bioinformatics/bty163. (通讯作者，SCI IF=7.31，中科院1区)

10、Wang C, L Wang, Y Ding, X Lu, G Zhang, J Yang, H Zheng, H Wang*, Y Jiang*, L Xu*. LncRNA Structural Characteristics in Epigenetic Regulation. Int. J. Mol. Sci. 2017, 18(12), 2659. (通讯作者，SCI IF=3.23，中科院3区)

11、瞿佳, 吕帆, 徐良德. 切实做好儿童青少年近视眼防控工作. 中华眼科杂志. 2019, 55(2):81-85. DOI: 10.3760/cma.j.issn.0412-4081. 2019.02.001.

教研课题

1、浙江省教学改革研究项目：“智慧+教育”模式下的本科实践教学体系改革与量化评价研究（JG20190282），徐良德主持，2020-01至2022-12，浙江省教育厅。

2、黑龙江省教育科学规划课题：“互联网+教育”模式下的本科实践教学体系建设与量化评价研究，徐良德主持，2015-12至2018-12，黑龙江省教育厅。

3、黑龙江省高教学会“十二五”规划课题重点课题：建立生物信息学教研体系提升学生理工科创新思维能力，徐良德主持，2012-01至2014-12，已结题，黑龙江省高教学会。

4、黑龙江省高等教育学会规划课题：“互联网+教育”模式下Seminar教学法在数学建模竞赛及创新教育中的应用，徐良德第一参与人，已结题，黑龙江省高等教育学会。

5、哈尔滨医科大学校医学教育研究课题：面向实践能力培养的生物信息学专业课程整合设计研究，徐良德第一参与人，2011-03至2012-12，已结题，哈尔滨医科大学。

6、黑龙江教育科学“十二五”规划课题重点课题：创新型生物医学信息学人才培养模式研究，徐良德第一参与人，2012-05至2014-12，已结题，黑龙江省教育科学规划办。

7、黑龙江省高等教育教学改革综合专项项目：面向转化医学的计算生物学产业开发战略型专业人才培养体系建设，徐良德第一参与人，2012-09至2016-06，已结题，黑龙江省教育厅。

8、中华医学会医学教育分会医学教育研究课题：面向创新能力培养的生物信息学专业课程体系建设，徐良德第一参与人，2012-10至2014-12，已结题，中华医学会医学教育分会。

9、黑龙江省高教学会优秀教育科研成果一等奖：创新型生物医学信息学人才培养模式研究。

10、黑龙江省高教学会优秀教育科研成果三等奖：以产学研结合为基础的生物信息学专业学生创新能力培养的教学改革与实践。

教材专著

1、国家十三五规划教材《高等数学》题库，副主编，人民卫生出版社，2019年7月，完成第5章无穷极数内容编写和题库统稿工作。

2、国家十三五规划教材《高等数学》第6版，编委，人民卫生出版社，2016年5月出版，完成第5章无穷极数、第9章常微分方程及其应用。

3、《高等数学学习指导与习题集》第6版，编委，人民卫生出版社，2016年5月出版。

4、国家十二五规划教材《生物信息学》第二版，编委，人民卫生出版社，2015年3月出版，完成第1章生物序列资源、第11章复杂疾病的计算系统生物学、第14章药物生物信息学。

5、《生物信息学学习指导与习题集），副主编，人民卫生出版社，2015年3月出版。

6、专著《生物信息学理论与医学实践》，编委，人民卫生出版社，2013年1月出版，完成第9章复杂疾病的系统遗传学分析。

7、卫计委十二五规划教材《生物信息学》第一版（含配套学习指导），参编，人民卫生出版社，2010年5月出版，完成第15章单核苷酸多态与人类疾病。